La connectivité latérale joue un rôle important, en particulier lors de crues. Les poissons réagissent à ces dernières en s’échappant par les côtés en quête de secteurs inondés mais à courant moins fort. Lorsque la crue s’atténue, ils reviennent dans le lit mineur. Les cours d’eau bétonnés n’offrent souvent plus cette connectivité latérale. Nombreux sont donc les poissons qui se font emporter vers l’aval lors des crues.
=== Migrations verticaes verticales ===
Dans les lacs, certaines espèces de poissons, comme les corégones (''Coregonus spp.''), entreprennent des migrations verticales quotidiennes et saisonnières. Ce faisant, ils suivent les déplacement de leurs proies, ou recherchent les températures plus adéquates des profondeurs. Les migrations verticales existent aussi, dans une moindre mesure, dans les cours d’eau. Les jeunes truites par exemple, passent l’hiver pour partie dans le système interstitiel du gravier.